מצב רעילות
רוב פעילי השטח האניונים והלא-יוניים אינם רעילים, וה-LD50 שלהם דומה לזה של מלח שולחן. עם זאת, הרעילות של תרכובות אמוניום רבעוניות עם השפעות אנטיבקטריאליות ואנטי פטרייתיות משתנה. לדוגמה, ה-LD50 של דיאלקידי-מתיל-אמוניום כלוריד (DDAC, DSDMAC) המשמש כמרככי כביסה הוא נמוך (5 גרם/ק"ג) ובעיקרו אינו רעיל, בעוד שה-LD50 של חומר החיטוי אלקיל-בנזיל-די-מתיל-אמוניום הוא 0.35 גרם/ק"ג.
ההשפעה על העור
חשיפה ארוכת טווח לחומרי שטח עלולה לגרות ולפגוע בעור, שכן חומרים פעילים יכולים לשבש את קרומי השומנים המגנים על העור ורקמות אחרות.